Šiuo metu Atgajos stovyklos vyksta trijose stovyklavietėse: Atgajos namuose Smarliūnuose (Lazdijų rajone), nuomojamoje Zelvos stovyklavietėje netoli Vievio, o rudenį ir pavasarį – „Auksinėje girioje” Molėtų rajone.
Stovyklaviečių teritorija aptverta, kad į ją nepatektų pašaliniai asmenys.
Įrengti vietiniai gręžiniai, tad iš čiaupų bėgantis vanduo yra filtruotas ir tinkamas gerti.
Visose stovyklavietėse maistas ruošiamas vietoje esančioje virtuvėje, Smarliūnuose ir Zelvoje vaikai maitinami 5 kartus per dieną. Jei stovyklos organizatoriai iš anksto informuojami apie vaiko turimas alergijas, maisto racionas pagal galimybes yra derinamas prie jų.
Smarliūnų stovyklavietė
Smarliūnai nuo Vilniaus yra nutolę apie 160 kilometrų. Tai nedidelis kaimas Dzūkijoje, 5 kilometrų atstumu nuo Veisiejų. Stovyklavietė yra įsikūrusi pačiame kaime, buvusios mokyklos pastate.
Smarliūnuose vaikai gyvena viename dviejų aukštų name, kambariuose po 5–7 vaikus. Kiekviename kambaryje yra po dušą ir tualetą. Pastate yra kelios bendros didelės erdvės, tad jei oras nėra tinkamas veikloms lauke, jos persikelia po stogu. Stovyklavietė įsikūrusi 3 ha teritorijoje, kurioje – amfiteatras, lauko stoginė pasirodymams, krepšinio aikštelė, dailės namelis su kūrybos priemonėmis ir drabužiais kostiumams bei dekoracijoms. Skirtingos stovyklos erdvės kūrybiškai išnaudojamos programai ir leidžia nuolat būti gryname ore. Už poros kilometrų nuo stovyklavietės yra ežeras, tad esant tinkamiems orams organizuojami žygiai ir maudynės.
Zelvos stovyklavietė
Zelvos stovyklavietė nuo Vilniaus yra nutolusi apie 50 kilometrų.
Zelvoje vaikai ir vadovai gyvena 4 atskiruose mediniuose nameliuose, viename jų – 25–40 vaikų, o kambariuose – po 2–5 vaikus. Kiekviename namelyje yra dušas ir tualetai, taip pat – bendro naudojimo dušai ir tualetai atskiruose pastatuose. Stovyklavietė yra apsupta miško ir įsikūrusi ant Zelvos ežero kranto. Teritorijoje yra dailės namelis, krepšinio, tinklinio aikštelės, skirtingos erdvės pasirodymams ir vaikų kūrybinėms idėjoms realizuoti, taip pat keletas erdvių po stogu, tinkamų veikloms, jei lauke lyja.
„Auksinėje girioje“ vyksta pavasario ir rudens stovyklos
Ši stovyklavietė įsikūrusi Asvejos regioniniame parke, apie 60 km nuo Vilniaus.
Apgyvendinimas elektra šildomuose mediniuose nameliuose su patogumais, 4–6 vietų kambariuose kartu su vadovais. Stovyklavietėje teikiamas tik vegetariškas maitinimas.
„Auksinė giria“ puikiai tinka stovyklavimui šaltuoju metų laiku, programai naudojamos įvairios erdvės – erdvi ir šviesi užsiėmimų salė, indėniški „tipiai“, kupoliniai „geodomai“, gyvenamojo pastato salė. Organizuojamos ir veiklos lauke, žygiai, nes stovyklavietė – nuostabaus grožio gamtos apsuptyje.