„Lietuvos atgaja“ kilo iš idėjos sukviesti pasaulio lietuvių vaikus, išsibarsčiusius po visą pasaulį, pažinti savo protėvių šalį, papročius ir kultūrą, suvokti savąjį identitetą, tobulinti lietuvių kalbos įgūdžius.
„Lietuvos atgajos“ ištakos – bendrijos „Lituanica“ bei Kultūros ir švietimo ministerijos organizuotos stovyklos užsienio lietuvių vaikams. Vieną vasarą vadovėmis padirbėti buvo pakviestos Aušra Lasauskaitė bei Dalia Lėckaitė. Jaunas vadoves taip „užkabino“ stovyklos idėja, kad 1993 metais jos nusprendė imtis iniciatyvos tokią stovyklą rengti pačios. Į komandą pasikvietė vieną Keistuolių teatro įkūrėjų – režisierių Romualdą Vikšraitį, tapusį pirmuoju stovyklos viršaičiu, tada dar vadintu „viršininku“, bei dailininkę Antanę Kaminskienę.
1993 metais įvykusi pirmoji Atgajos pamaina skyrėsi nuo dabartinių stovyklų – programa vyko 3 savaites, dar nebuvo susiformavusių tradicijų, su 80 vaikų tedirbo 8 vadovai, stovykla neturėjo vientisos temos. Tačiau stovyklos vertė stovyklautojams ir rengėjams buvo didžiulė, tad po 1993 vasaros imtasi planų stovyklą tęsti. Atsiranda stovyklos būstinė, išlikusi iki šių dienų – Žalianamis.
1994 metais vyksta jau 2 Atgajos stovyklos pamainos, pirmosios jų vadovai – Keistuolių teatro aktoriai, į stovyklą atnešantys daug teatrinių metodų. Įgyvendinama Kalendorinių švenčių programa, pirmą kartą vietoje būrių kuriamos stovyklos šeimos, pamažu kuriasi stovyklos tradicijos.
1995 metais pradedamas sistemingas vadovų rengimas, vyksta pirmieji seminarai.
Metams bėgant, plečiasi stovyklos programų spektras, kiekviena programa įgyvendinama ne po vieną kartą. Pirmosios pamainos – Kalendorinių švenčių, Šeimos švenčių (vestuvių), programa tautinių mažumų vaikams „Visi skirtingi, visi lygūs“, Mitologinė, Istorinė, Teatrinė, Dailės. Stovyklos vadovai tampa programų kūrėjais, patys inicijuoja naujas pamainų temas. Šiandien kiekviena stovyklos programa – unikali ir įvykdoma vienintelį kartą.
Per 30 veiklos metų Atgaja vyko įvairiose vietose. Nuo 2008 metų džiaugiamės turėdami tikrus namus – stovyklavietę Smarliūnuose.
„Lietuvos atgaja“ nėra statiška, ji nuolat auga ir keičiasi: stovyklą kuria į ją atvykstantys vaikai ir vadovai, į programas sudedantys tai, kas jiems patiems aktualu ir svarbu. Daug dėmesio skiriama ne tik papročiams, bet šiuolaikinės lietuviškosios kultūros reiškiniams – literatūrai, kinui, įvairiems judėjimams. Išlaikydami nuoseklius stovyklos tikslus, kasmet ieškome naujų formų, įgyvendiname skirtingas idėjas. Tikime, kad atvirumas kaitai, bendruomenės įsitraukimas ir besikeičiančių vaikų poreikių atliepimas lemia tai, kad Atgaja jau 30 metų yra stipri ir reikalinga.
2018 m. režisierės Agnės Marcinkevičiūtės dokumentinį filmą apie „Lietuvos atgają“ „Lietuviškos vasaros beieškant“ pamatyti galite čia:
Nuo 2021 m. pradėtas bendradarbiavimas su „Skautų slėnio“ stovyklaviete: čia per vasarą rengiamos 4 pamainos, tad nuo 2021 m. Atgajos vasarą vyksta iš viso 14 pamainų.
2022 m. „Lietuvos atgaja“ atšventė 30 stovyklos gimtadienį.